1997年由江苏省政府批复为省级高新区,2015年2月经国务院批准升格为国家级高新区,同年9月正式挂牌成立。连云港高新技术产业开发区采取"一区五园"的发展模式,"一区"即核心区,"五园"即五个产业辐射园,分别为新医药产业园、新材料产业园、清洁能源创新产业园、装备制造产业园和节能环保科技园。以国家级创新型特色园区为发展目标,按照"中国制造2025"、"互联网+"行动计划和供给侧结构性改革战略部署,聚焦"高端型、融合型、服务型、平台型"四型经济,以跨界融合创新为手段,重点发展智能制造装备、大健康、软件与信息服务、科技服务业等。