蒿溪回族乡在民国二十四年(1935年),设薅大联保。1958年,乡改公社,属曲河区。1984年,薅溪公社改为薅溪回族乡。1992年,撤青溪区,薅溪回族乡直属青川县。1994年,更名蒿溪回族乡。 截至2020年6月,蒿溪回族乡下辖4个行政村。2019年,蒿溪回族乡有工业企业1个,有营业面积超过50平方米以上的综合商店或超市5个。蒿溪回族乡境内有105省道过境,境内长10.4千米。通村公路总长65千米,其中硬化为水泥路面的40千米。蒿溪回族乡境内已探明矿藏资源有铁、铜、锌、金、汞、铀、石英、石灰石、白云岩、重晶石、镐、煤炭等。