重庆高新技术产业开发区于1991年3月经国务院批准成立,是首批5个国家综合改革试点开发区之一。2007年底,北部新区、经开区、高新区实行“三区合一”管理体制,此段时期的高新区辖70平方公里,包括石桥铺高新科技开发园、二郎科技新城20平方公里和北部新区高新园50平公里。2010年6月,重庆两江新区管委会挂牌成立。为了更好发挥高新区、经开区的作用,市委、市政府决定北部新区与高新区、经开区分设,2010年7月,市政府召开经开区高新区移交工作暨动员大会,随即九龙坡区委、区人民政府与北部新区党工委、管委会签定《重庆高新区移交协议》,就财政体制、建设项目、资产划转、机构人员等移交事项进行了明确。