菏泽高新区地处菏泽市区西部,辖万福办事处、吕陵镇、马岭岗镇。2008年1月被省政府列为省级高新技术产业开发区,2013年10月理顺管理体制,是国家火炬生物医药特色产业基地、国家生物医药大健康创新型产业集群试点、国家级知识产权集群化管理试点区、山东省创新药物(菏泽)孵化基地、省级战略性新兴产业(生物医药)示范基地。2019年,实现地区生产总值86亿元,增长3%;完成一般公共预算收入11.4亿元,税收、主体税种占比分别为90.4%、68.5%,均位居全市前列;规模以上工业企业实现主营业务收入263亿元、利润57.6亿元;完成固定资产投资51亿元,增长8%。