瑶沟乡境内原有瑶沟酒厂、葡萄酒厂、建材厂和面粉加工厂4个企业。1984年后，由于管理不善，连年亏损。瑶沟酒厂1989年亏损125万元。葡萄汁原料滞销，为减轻贷款压力，砍掉700亩葡萄改种粮食。

               2015年，瑶沟乡累计流转土地1.5万亩，高效林果0.5万亩、设施农业1200亩、绿化苗圃0.1万亩、稻麦良种3.5万亩，占总耕地面积54.8%。瑶沟乡已成立种植、养殖、劳务等各类合作社54家，新成立家庭农场23家，有效促进4251人次务工，实现农民增收24.1万元。

               经济原以畜牧为主，为泗洪县繁殖大牲畜良种服务的乡镇级牧业企业兼行政管理单位。1963年，省农业厅利用位于车门乡和双沟、魏营2乡境内约2万亩地水草资源，引进100多头印度么拉牛、海子牛和内蒙古的50多匹良种马，分别成立种牛场、种马场。

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